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Microbeads and focus quality test for use in digital pathology microscope scanners

IP.com Disclosure Number: IPCOM000246487D
Publication Date: 2016-Jun-10
Document File: 9 page(s) / 2M

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Microbeads and focus quality test for use in digital  pathology microscope scanners



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Microbeads slides available on the market

• Functionalized microscopic slides from PolyAn • Polystyrene microbeads from PolyScience: • Blue: 3, 6 and 10 µm • Red: 6 µm • Yellow: 3, 6 and 10 µm
• Mounting fluid is Vectamount H‐5000

• Pattern creation by: • Nanodrop printer
• Variation of bead concentrations and volume in printing 

liquid creates different patterns and mixtures


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Layout First Microbeads Slide

Microscope glass slide with 4 different types of  bead patterns as indicated below

3x

• Relative simple layout 

• Focus quality algorithms tested on 

  this slide as reference
• Slides can be distributed to 

interested parties that are willing  to provide feedback

3x

3x

3x

   Blue  3 µm + 10µm 

Yellow 3 µm 

Red 6 µm 

Blue 3 µm 

         


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Scanned reference slide used for focus algorithm tests

Section with blue beads of 3 µm diameter are  selected for first tests of focus algorithm

Scanned reference slide (black = area of non‐interest)

Calculation of number of  beads and focus performance  is done per tile window


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Automatic detection center of beads per tile by  color based algorithm in Matlab



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Focus algorithms from literature

Sourc...